National Center for Biotechnology Information

https://www.ncbi.nlm.nih.gov

  • Je ne sais pas si cette carte est exacte, mais elle est très jolie.

    Fabien Abraini
    @Fabiensapiens

    Fil passionant sur la consommation de lait chez les humains.
    https://twitter.com/Fabiensapiens/status/1190696948967395328

    De toute façon, le lait, c’est pour les veaux. Aucun animal ne boit le lait d’une autre espèce. Et on n’en a jamais bu au paléolithique !
    C’est vrai, ça. Qu’est-ce qui nous a pris de consommer du lait à partir du néolithique ?

  • Lebanese brave badly polluted water to swim at public beaches - Reuters

    https://www.reuters.com/article/us-lebanon-pollution-idUSKCN1UC1PR

    BEIRUT (Reuters) - On a beach in northern Lebanon, men and women swim in the Mediterranean’s warm blue waters close to a sewage outlet, while children play in sand that is strewn with litter.

    Clichés : Août 2019, sewage water drop off ...
    #liban #eau #beyrouth #pollution #santé

    • it safe to go back into the water? A systematic review and meta-analysis of the risk of acquiring #infections from recreational exposure to seawater
      https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5913622/pdf/dyx281.pdf

      This is the first systematic review to evaluate the evidence that bathers are at risk of getting sick from exposure to sea- water, and to quantify this risk compared with non- bathers. The findings indicate that bathers are at a higher risk of experiencing a variety of symptoms of illness compared with non-bathers, including ear ailments, gastroin- testinal illness and symptoms of any illness. Recreational exposure to coastal waters is likely to cause these illnesses, although future epidemiological studies should aim to identify the microorganisms responsible for observed symptoms, to address the issue of specificity.

      #plages #baignades #santé

  • Une IA capable de détecter le cancer du sein
    https://usbeketrica.com/article/ia-capable-detecter-cancer-sein

    Une équipe de chercheurs du MIT a mis au point une intelligence artificielle capable de détecter un cancer du sein jusqu’à cinq ans avant sa formation, quelle que soit la couleur de peau de la patiente.

    Chaque année, on compte 54 000 nouvelles personnes touchées par le cancer du sein en France, ce qui en fait le cancer le plus répandu chez les femmes. Malgré des campagnes de dépistage importantes, de nombreux cas sont repérés trop tard pour être soignés efficacement. Face à cet enjeu, des chercheurs du Massachusetts Institute of Technology (MIT) essaient d’intégrer l’intelligence artificielle à leurs recherches afin de dépister le cancer plus tôt. Les résultats de leurs travaux ont été publiés, mardi 7 mai, dans la revue Radiology.

    L’intelligence artificielle sur laquelle travaille le MIT permettrait de prédire un cancer du sein jusqu’à cinq ans avant son apparition, à travers l’analyse d’une simple mammographie. Pour arriver à ce résultat, les chercheurs ont analysé les données de plus de 60 000 patientes issues de l’Hôpital général du Massachusetts, précise le site du MIT. Comme les images utilisées avaient été prises plusieurs années auparavant, les chercheurs ont été en mesure d’apprendre à la machine quelles mammographies correspondaient à des femmes ayant développé le cancer du sein et lesquelles ne présentaient aucun signe de cancer.
    Une IA (un peu) plus inclusive

    Pour rendre leur intelligence artificielle plus équitable, les scientifiques lui ont montré des données représentatives de différentes couleurs de peau (l’enjeu étant de permettre à l’IA de repérer les signes avant-coureurs d’un cancer aussi bien sur des personnes blanches que non blanches). Verdict des chercheurs : « Cela fonctionne aussi bien sur des patientes noires que sur des personnes blanches ».

    Données issues d’une étude publiée en 2014 sur le site Wiley Online Library

    La diversité des données reste toutefois très faible, puisque seulement 5 % d’entre elles concernent des femmes noires et 4 % des femmes asiatiques, alors que 81 % proviennent de patientes à la peau blanche. Les chercheurs du MIT cherchent à inclure encore davantage les minorités dans leurs recherches, comme ils l’expliquent au site Engadget : « Nous continuons activement les collaborations avec d’autres hôpitaux pour faire en sorte que notre modèle soit équitable et qu’il fonctionne sur des populations diverses. »
    Un enjeu d’avenir

    Ces enjeux deviennent de plus en plus importants à mesure que l’intelligence artificielle fait son entrée dans le domaine de la santé et de la médecine prédictive. Aujourd’hui, aux États-Unis, les femmes noires ont 42% plus de risques de mourir d’un cancer du sein que les femmes blanches, précise le MIT. Parallèlement, les femmes noires, hispaniques et asiatiques développent le cancer du sein plus tôt en moyenne que les femmes blanches. Et avec le recours à l’intelligence artificielle, ces inégalités risquent encore s’amplifier si les données fournies aux IA ne sont pas plus représentatives.

    Pour gommer ces biais, il s’agit donc de renouveler et diversifier les données médicales. Et il y a fort à faire en la matière puisque, depuis vingt ans, les inégalités liées à la couleur de peau face au cancer n’ont pas diminué, comme le montre une étude publiée en 2014. Elles auraient même augmenté dans le cas du cancer du sein.

    #inégalités #cancer_du_sein #MIT #IA #prédictions_médicales

    • L’intelligence artificielle sur laquelle travaille le MIT permettrait de prédire un cancer du sein jusqu’à cinq ans avant son apparition, à travers l’analyse d’une simple mammographie. Pour arriver à ce résultat, les chercheurs ont analysé les données de plus de 60 000 patientes issues de l’Hôpital général du Massachusetts, précise le site du MIT. Comme les images utilisées avaient été prises plusieurs années auparavant, les chercheurs ont été en mesure d’apprendre à la machine quelles mammographies correspondaient à des femmes ayant développé le cancer du sein et lesquelles ne présentaient aucun signe de cancer.

      A noter : utilisation du conditionnel et sauf erreur de ma part on est bien sur des bases de travail statistiques et on détecte donc des corrélations et des probabilités, pas des causalités...

    • oui @suske tout cela est au conditionnel, on est d’accord que ce n’est pas très scientifique. Mais ça signifie aussi qu’un cancer du sein peut débuter 5 ans avant et non pas seulement 2 ans comme les médecins le disent souvent.
      Quand j’ai présenté une mammographie de plus de 20 ans avec des annotations au même endroit de cellules bizarres à Curie on m’a répondu que « la médecine n’est pas une science exacte ». Et il y a 10 ans, consultant en urgence, je me suis fait insulter par une gynéco parce que « madame ce sont vos glandes mammaires, c’est normal vous avez des seins, vous êtes une femme ».
      J’estime que les études techniques ça fait surtout plaisir aux techniciens de la santé et à ceux qui espèrent un retour sur investissement à force de #fichage.
      Et que tant que le corps médical refusera d’écouter les patient·es, les médecin·es continueront d’accumuler les erreurs médicales et les diagnostics d’ignares dangereux.
      Donc, chères sœurs, faites vous confiance, changez de médecin si il ou elle refuse de vous entendre.
      #santé #médecine #ecouter_les_femmes

    • L’étude originale :
      A Deep Learning Mammography-based Model for Improved Breast Cancer Risk Prediction | Radiology
      https://pubs.rsna.org/doi/abs/10.1148/radiol.2019182716

      Abstract
      Background
      Mammographic density improves the accuracy of breast cancer risk models. However, the use of breast density is limited by subjective assessment, variation across radiologists, and restricted data. A mammography-based deep learning (DL) model may provide more accurate risk prediction.

      Purpose
      To develop a mammography-based DL breast cancer risk model that is more accurate than established clinical breast cancer risk models.
      […]
      Conclusion
      Deep learning models that use full-field mammograms yield substantially improved risk discrimination compared with the Tyrer-Cuzick (version 8) model.

      Et, en effet, il s’agit de comparer des méthodes de détection. Le résultat principal se lit sur ce graphique (dit #courbe_ROC)


      Figure 2 : Receiver operating characteristic curve of all models on the test set. All P values are comparisons with Tyrer-Cuzick version 8 (TCv8). DL = deep learning, hybrid DL = DL model that uses both imaging and the traditional risk factors in risk factor logistic regression, RF-LR = risk factor logistic regression.

      Il montre que la courbe (en rouge) correspondant à l’utilisation de l’IA sur l’image et les facteurs de risque classiques produit toujours un plus faible nombre de faux positifs que les méthodes sans IA.

      La courbe verte (IA sur l’image seule) n’est pas aussi performante que la rouge ; elle est moins bonne que la méthode traditionnelle dans le bas de la courbe.

      La « détection parfaite » correspondrait à deux segments de droite longeant les bords gauche et supérieur du carré.

    • Comme tu le soulignes, @vraiment, l’étude ne porte que sur les éléments médicaux. Aucune trace des déclarations des patientes, en effet.

      Mais ça signifie aussi qu’un cancer du sein peut débuter 5 ans avant

      Je reformulerais en précisant que l’étude montre que le cancer était détectable (par ces méthodes) dans les 5 ans qui précèdent sa détection effective. L’étude a porté sur 40000 mammographies effectuées dans un intervalle de 4 ans (2009 à 2012) dans un grand centre médical et en recoupant d’une part avec le registre des tumeurs déclarées dans les 5 ans suivant de 5 hôpitaux, mais aussi avec des mammographies post-traitement.

      Le délai de détection ainsi gagné par l’utilisation de ces techniques n’est pas indiqué. Ni, à mon avis, aisément déterminable.

    • 100% d’accord sur l’écoute.

      Une des difficultés est aussi de s’exprimer face au médecin... Ici on est clairement dans une idée du type : une mammo, une AI et le tour est joué. L’écoute de l’expression des patientes est limite inutile dans ce paradigme. Pour cela je n’ai pas apprécié cet article dont la structure me semble conforter ce défaut :
      1. titre factuel favorable à l’AI
      2. rappel de « l’importance de la détection précoce »
      3. conditionnel : possibilité de prédire jusqu’à 5 ans
      4. le tout sur base de dossiers d’imagerie...

      Il ressort une impression de « on va pouvoir détecter tout à temps » alors que ce que je comprends c’est que l’AI réduit (logiquement) un peu la subjectivité de l’interprétation. C’est déjà bien, pas besoin d’en rajouter en parlant de capacité de l’AI et de prédictibilité...

    • Moi je me questionne du coup sur ce qui change sur une mammographie en fonction de la couleur de peau ; le contraste de l’image résultante n’est pas le même ? (a priori c’est pas ça) Ou c’est que les cancers du sein ne se développent pas forcément de la même façon suivant le milieu social, la couleur ?

      The majority of existing risk models were developed on predominantly white populations (1,3,4) and have known limitations in predicting risk for other racial groups (17–20)

    • Relativement à la mammographie, le facteur #densité_mammaire (#breast_density) est régulièrement mis en avant.

      cf. les explications de la Clinique Mayo où l’on voit clairement l’impact sur la lecture de l’image.

      Après, le lien entre l’ethnicité, la densité mammaire et le niveau de risque relatif est discuté. Deux exemples, après recherche rapide,…

      • ici une étude de 2007, Mammographic breast density and race qui conclut que le lien densité/race existe mais qu’il disparait lorsqu’on prend en compte les facteur âge et IMC (Indice de Masse Corporel) … sauf pour les Asiatiques
      https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17377060

      • là, en Nouvelle-Zélande en 2013, c’est le contraire…
      Age and Ethnic Differences in Volumetric Breast Density in New Zealand Women : A Cross-Sectional Study
      https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3729838

      As well as expected age differences, we found differential patterns of breast density by ethnicity consistent with ethnic differences seen in breast cancer risk. Breast density may be a contributing factor to NZ’s well-known, but poorly explained, inequalities in breast cancer incidence.

      Comme l’indique la conclusion de cette dernière étude, on ne sait pas pourquoi…

      Les quatre références citées en note (17 à 20) par l’étude sur l’IA se contentent de constater les différences, comparent la sous-estimation des risques obtenus par différentes méthodes et, éventuellement, proposent des étalonnages (anglais : calibration) différents pour les différentes races.

  • Male house flies have eyes for their ladies - specialized, love spotting eyes
    https://massivesci.com/notes/male-house-flies-have-eyes-for-their-ladies-specialized-love-spotting-ey

    When you hear the phrase “love spot”, I’m sure the last thing you think of is the common housefly. However, did you know that 15 different families of fly, including the mayfly, a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5154687"...

  • Big data, multiplication des antennes et des ondes : bienvenue dans le monde merveilleux de la 5G (Basta)
    https://www.crashdebug.fr/sciencess/15909-big-data-multiplication-des-antennes-et-des-ondes-bienvenue-dans-le

    C’est un nouvel eldorado pour les opérateurs de téléphonie et la Commission européenne. Celle-ci y voit la promesse d’une forte croissance et de centaines de milliers d’emplois d’ici 2025. La 5G fait fantasmer, avec son débit ultra-rapide, la possibilité de développer des millions d’objets connectés « intelligents », et les milliards de données qu’elle permettra de collecter. Au delà de la mise en scène marketing, son utilité et ses retombées économiques réelles n’ont rien d’une évidence. Pour déployer le réseau, les antennes-relais devront être bien plus nombreuses, avec toutes les interrogations que suscitent les effets sanitaires d’une densification des ondes. Le collectif de journalistes Investigate Europe, partenaire de Basta !, a mené l’enquête.

    Un véhicule blanc, futuriste, apparaît à l’écran. Madame (...)

    https://lavolte.net/livres/les-furtifs-alain-damasio
    https://www.anfr.fr/toutes-les-actualites/actualites/installation-du-comite-national-de-dialogue-relatif-aux-niveaux-dexposition-du-
    https://www.economie.gouv.fr/files/files/Actus2018/Feuille_de_route_5G-DEF.pdf
    http://www.priartem.fr/http://www.priartem.fr/accueil.html
    https://www.iarc.fr/wp-content/uploads/2018/07/pr208_F.pdf
    https://www.investigate-europe.eu
    https://www.numerama.com/politique/466256-5g-et-espionnage-les-deputes-proposent-une-loi-taillee-contre-huawe
    https://eur-lex.europa.eu/legal-content/EN/ALL/?uri=COM:2016:0588:FIN
    https://www.arcep.fr/cartes-et-donnees/nos-publications-chiffrees/experimentations-5g-en-france/tableau-deploiements-5g.html
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29459303
    https://journals.lww.com/health-physics/Abstract/2018/12000/Systematic_Derivation_of_Safety_Limits_for.17.aspx
    https://www.lecho.be/entreprises/telecom/celine-fremault-la-5g-les-bruxellois-ne-sont-pas-des-souris-de-laboratoire/10112569.html)

  • #Eels in #Thames ’left hyperactive due to high levels of #cocaine in water’ | #London Evening Standard
    https://www.standard.co.uk/news/london/eels-in-thames-left-hyperactive-due-to-high-levels-of-cocaine-in-water-a

    London’s water treatment plants are failing to filter out the class A drug, while downpours are overwhelming waste plants and carry sewage into the river.

    "Increases in #caffeine, cocaine and #benzoylecgonine were observed 24 hours after #sewer #overflow events,” the reseachers said.

    "Concentrations of cocaine and benzoylecgonine remained high in wastewater across the week with only a minor increase over the weekend, which is not consistent with other cities, “ the reseachers said in a paper.

    “London is known as one of the highest consumers of cocaine.”

    • Ca me rappelle cet article :

      Estimation of illicit drugs consumption by wastewater analysis in Paris area (France).
      Karolak S, Nefau T, Bailly E, Solgadi A, Levi Y. Forensic. Sci. Int. 200:153-160 (2010)
      https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20447786

      Cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BZE), amphetamine, 3,4-methylenedioxymethamphetamine (MDMA) and buprenorphine were measured in raw water and WWTP effluent using HPLC-MS/MS after SPE extraction. Amphetamine was rarely detected. Cocaine and BZE were quantified at levels from 5 to 282 ng L(-1) and 15 to 849 ng L(-1), respectively. MDMA and buprenorphine concentrations remained under 20 ng L(-1). Cocaine consumption was estimated from cocaine or BZE concentrations measured in raw water and the results showed significant difference in drug taking during week or weekend. The estimated doses observed in this study are lower than those reported for others countries, especially Spain and Italy. MDMA consumption was estimated at lower levels than cocaine.

      #cocaine #MDMA #drogues #France #Mass_spectrometry

  • The normalization of deviance

    Social normalization of deviance means that people within the organization become so much accustomed to a deviation that they don’t consider it as deviant, despite the fact that they far exceed their own rules for the elementary safety

    —Diane Vaughan, 1996

    The normalization of deviance in healthcare delivery, by John Banja
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2821100

    In other words, mistakes such as failing to check or record a lab finding, ordering the wrong drug, or entering a lab finding in the wrong patient’s chart are usually not enough to guarantee an occurrence of harm. The recipe for disaster additionally requires these errors, lapses, or mistakes to go unattended, unappreciated, or unresolved for an extended period of time.

    In software Engineering, by Dan Luu
    https://danluu.com/wat

    In engineering (and eventually life in general), by Foone Turing
    https://foone.wordpress.com/2019/02/14/normalization-of-deviance

    #normalizationOfDeviance #sociology #risk

  • Sexist Humor and Rape Proclivity: The Moderating Role of Joke Teller Gender and Severity of Sexual Assault. - PubMed - NCBI
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27386879

    Three experiments examined the effect of sexist humor on men’s self-reported rape proclivity (RP). Pilot study demonstrated that people differentiate the five rape scenarios of Bohner et al.’s. RP Scale based on the degree of physical violence perpetrated against the victim. Experiment 1 demonstrated that men higher in hostile sexism report greater RP upon exposure to sexist jokes when a woman (vs. a man) delivers them, and that this effect is limited to rape scenarios depicting a moderate versus a high level of physical violence. Experiment 2 further demonstrated that the relationship between hostile sexism and rape proclivity in response to a moderately violent rape scenario after exposure to sexist humor generalizes beyond women in the immediate humor context to women as a whole.
    KEYWORDS:

    rape proclivity; sexism; sexist humor

  • Neonatal Abstinence Syndrome: An Update
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5843557

    Purpose of review

    This review provides an update focused on the evolving epidemiology of neonatal abstinence syndrome (NAS), factors influencing disease expression, advances in clinical assessment of withdrawal, novel approaches to treat NAS, and the emerging role of quality improvement work in the field of NAS.

    The rise in the incidence of NAS disproportionately occurred in rural and suburban areas. Polysubstance exposure and genetic polymorphisms modified NAS expression and severity. Several centers have explored the use of new bedside assessments, focused on fewer factors to identify infants with NAS, that resulted in a decreased proportion of infants receiving pharmacotherapy for NAS. In addition, buprenorphine was shown to be a promising therapeutic alternative to morphine for treatment of NAS. Lastly, local, state and national quality improvement initiatives aimed to improve outcomes for infants with NAS emerged as an effective manner to advance the care of infants with NAS.

    NAS remains a critical public health issue associated with significant medical, economic and personal burden. Emerging data on drivers of disease, assessment of withdrawal and treatment for NAS provide clinicians and hospitals with new knowledge and an urgency to promote standardization of care for infants with NAS.

    #Bébés #Opioides #Syndrome_sevrage_neonatal

  • The Promotion and Marketing of OxyContin: Commercial Triumph, Public Health Tragedy
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2622774

    Un article scientifique de 2009 sur le marketing d’Oxycontin.

    OxyContin’s commercial success did not depend on the merits of the drug compared with other available opioid preparations. The Medical Letter on Drugs and Therapeutics concluded in 2001 that oxycodone offered no advantage over appropriate doses of other potent opioids.3 Randomized double-blind studies comparing OxyContin given every 12 hours with immediate-release oxycodone given 4 times daily showed comparable efficacy and safety for use with chronic back pain4 and cancer-related pain.5,6 Randomized double-blind studies that compared OxyContin with controlled-release morphine for cancer-related pain also found comparable efficacy and safety.7–9 The FDA’s medical review officer, in evaluating the efficacy of OxyContin in Purdue’s 1995 new drug

    application, concluded that OxyContin had not been shown to have a significant advantage over conventional, immediate-release oxycodone taken 4 times daily other than a reduction in frequency of dosing.10 In a review of the medical literature, Chou et al. made similar conclusions.11

    The promotion and marketing of OxyContin occurred during a recent trend in the liberalization of the use of opioids in the treatment of pain, particularly for chronic non–cancer-related pain. Purdue pursued an “aggressive” campaign to promote the use of opioids in general and OxyContin in particular.1,12–17 In 2001 alone, the company spent $200 million18 in an array of approaches to market and promote OxyContin.❞

    From 1996 to 2001, Purdue conducted more than 40 national pain-management and speaker-training conferences at resorts in Florida, Arizona, and California. More than 5000 physicians, pharmacists, and nurses attended these all-expenses-paid symposia, where they were recruited and trained for Purdue’s national speaker bureau.19(p22)

    In much of its promotional campaign—in literature and audiotapes for physicians, brochures and videotapes for patients, and its “Partners Against Pain” Web site—Purdue claimed that the risk of addiction from OxyContin was extremely small.43–49

    Purdue trained its sales representatives to carry the message that the risk of addiction was “less than one percent.”50(p99)

    In 1998, Purdue distributed 15 000 copies of an OxyContin video to physicians without submitting it to the FDA for review, an oversight later acknowledged by Purdue. In 2001, Purdue submitted to the FDA a second version of the video, which the FDA did not review until October 2002—after the General Accounting Office inquired about its content. After its review, the FDA concluded that the video minimized the risks from OxyContin and made unsubstantiated claims regarding its benefits to patients.19

    When OxyContin entered the market in 1996, the FDA approved its original label, which stated that iatrogenic addiction was “very rare” if opioids were legitimately used in the management of pain. In July 2001, to reflect the available scientific evidence, the label was modified to state that data were not available for establishing the true incidence of addiction in chronic-pain patients. The 2001 labeling also deleted the original statement that the delayed absorption of OxyContin was believed to reduce the abuse liability of the drug.19 A more thorough review of the available scientific evidence prior to the original labeling might have prevented some of the need for the 2001 label revision.

    #Opioides #Marketing #Purdue_Pharma

  • Pourquoi tout le monde n’a pas l’oreille absolue - YouTube
    https://www.youtube.com/watch?v=huVHMO4bLc0&feature=em-uploademail

    En musique, l’oreille absolue, c’est la capacité de nommer les notes dès qu’on les entend. Contrairement à l’oreille relative, qui désigne la faculté de reconnaître une note à partir d’une note de référence, l’oreille absolue est très rare. En occident, elle concernerait une personne sur dix mille. Pourquoi certaines personnes ont-elles l’oreille absolue, et d’autres pas ? Que se passe-t-il dans le cerveau des personnes qui en sont dotées ? Comment acquiert-on cette capacité ? Peut-on l’apprendre adulte ? Eléments de réponse sur ce qui demeure encore un mystère scientifique, à l’occasion de la Fête de la musique 2018.

    Sources :
    – Daniel Levitin - L’Oreille absolue : autoréférencement et mémoire
    https://www.persee.fr/doc/psy_0003-50...
    – Daniel Levitin - Absolute Pitch : Self-reference and Human Memory
    http://daniellevitin.com/levitinlab/a...
    – Diana Deutsch - L’Enigme de l’oreille absolue
    – Robert J. Zatorre - The Cognitive Neuroscience of Music
    – Patrick Bermudez, Robert J. Zatorre - The Absolute Pitch Mind Continues to Reveal Itself
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/arti...
    – Hervé Platel, Francis Eustache, Bernard Lechevalier - Le Cerveau musicien

  • Ebola en RDC : des guérisons grâce à la vaccination | Euronews
    http://fr.euronews.com/2018/05/30/ebola-en-rdc-des-guerisons-grace-a-la-vaccination

    L’épidémie d’Ebola s’est déclarée à Bikoro, à 600 km de Kinshasa, à la frontière avec le Congo-Brazzaville. Le dernier bilan fait état de 54 cas, dont 25 décès.

    Plus de 400 personnes ont été vaccinées jusqu’à présent, la majorité d’entre elles à Mbandaka, a-t-il indiqué, précisant que les premières opérations de vaccination ont démarré à Bikoro et « vont démarrer cette semaine à Iboko », un village de la région de Bikoro.

    Un haut responsable de l’OMS a affirmé que le vaccin avait été bien accepté et que jusqu’à présent « il n’y a pas eu d’augmentation explosive de cas ». « Nous avons des raisons de faire preuve d’un optimisme prudent ».

    Aucune mention de la société ou de l’organisme qui a mis au point le vaccin utilisé. C’est secret ? (je me doute de la réponse, mais je me contente de l’interrogation candide, le journaliste ne s’est peut-être lui même pas posé la question).

  • Je tombe sur cette étude :

    Sexual deprivation increases ethanol intake in Drosophila.
    Shohat-Ophir G, Kaun KR, Azanchi R, Mohammed H, Heberlein U.
    Science 335:1351-1335 (2012)
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22422983

    Elle montre deux choses : 1) que l’on peut mesurer la frustration sexuelle (absence de rapports sexuels) chez les drosophiles mâles et 2) que cette frustration est corrélée avec une plus grande consommation d’alcool. Le tout est lié au fonctionnement d’une molécule (le neuropeptide F ou Y) que possèdent aussi des mammifères et qui pourrait donc être impliquée dans le mécanisme de l’addiction.

    Bien sûr, ça fait rire tout le monde, par exemple ici :

    Chez les mouches, le mâle sombre dans l’alcool par frustration sexuelle
    Le Monde, le 16 mars 2012
    http://bigbrowser.blog.lemonde.fr/2012/03/16/science-chez-les-mouches-le-male-sombre-dans-lalcool-par-fru

    On peut déjà se demander pourquoi l’étude ne mesure pas cet effet chez les drosophiles femelles.

    Mais une autre critique est publiée deux ans plus tard :

    Male sexual behaviour and ethanol consumption from an evolutionary perspective : A comment on « Sexual Deprivation Increases Ethanol Intake in Drosophila ».
    Guevara-Fiore P, Endler JA.
    Fly 8:234-236 (2014)
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25970263

    Ils remarquent aussi que de nombreux articles ont été publié avec des interprétations anthropomorphiques erronées. En effet, les drosophiles mangent des fruits et leur odorat est guidé par l’alcool émis par les fruits qui pourrissent, et leur rapport à l’alcool est donc très différent de celui des humains. Ils proposent d’autres expériences, en particulier avec des drosophiles femelles. Cela dit, en suivant leur raisonnement, l’analogie chez l’humain serait de manger plus quand on est frustrés sexuellement ?

    J’ai entendu parler de cette histoire, parce qu’un nouvel article vient de paraître :

    Ejaculation Induced by the Activation of Crz Neurons Is Rewarding to Drosophila Males.
    Zer-Krispil S, Zak H, Shao L, Ben-Shaanan S, Tordjman L, Bentzur A, Shmueli A, Shohat-Ophir G.
    Curr. Biol. doi : 10.1016/j.cub.2018.03.039 (2018)
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29681474

    Il ne dit pas grand chose de plus, si ce n’est que, là, c’est l’absence d’éjaculation qui est testée, et les femelles sont donc prises en compte, comme contrôle négatif.

    Au passage, quelques petits détails :
    –On peut remarquer que le premier article s’accompagne d’un erratum, les auteurs ayant « oublié » d’inclure Mohammed, H dans les co-auteurs
    –On peut aussi remarquer dans le dernier article, que l’auteure principal, Galit Shohat-Ophir, s’est déplacée des USA en Israel
    –Du coup il est aussi marrant de remarquer que l’article critique a été écrit par une dénomée Palestina Guevara-Fiore !

    #Drosophiles #Mouches #sexualité #orgasme #frustration #animaux #ethanol #alcohol #addictions et aussi #Palestine

    A rajouter à la compilation d’article sur la sexualité animale et humaine :
    https://seenthis.net/messages/686795

  • Pain Management and the Intersection of Pain and Opioid Use Disorder - Pain Management and the Opioid Epidemic - NCBI Bookshelf
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK458655

    This chapter addresses the scope of the problem of pain in the United States and its association with opioids, and the effectiveness of pharmacologic (both opioid and nonopioid) and nonpharmacologic treatments that may, alone or in combination, help individuals manage pain. The first section summarizes the scope of the problem of pain, focusing in particular on chronic, or persistent, pain, the form most associated with problematic use of opioids. The chapter then presents a detailed discussion of the various pain treatment modalities, reviewing in turn opioid analgesics, nonopioid pharmacologic treatments, interventional pain therapies, and nonpharmacologic treatments. This section is particularly important in helping to contextualize the evidence of effectiveness and limitations for various treatments for pain, given the burden of pain, the risks associated with undertreatment, and the pervasiveness of opioid use and related dose-dependent risks. The next section examines differences in pain experiences and treatment effectiveness among subpopulations, and the final section briefly addresses the intersection between pain and opioid use disorder (OUD) (discussed in greater detail in Chapter 3). A main objective of this chapter is to situate opioids within the broader armamentarium of treatments available for management of pain and to identify potential opportunities for reduced reliance on these medications.

    The very real problems of underdiagnosis and undertreatment of pain are valid concerns, but it would be a mistake to infer that greater utilization of opioids would ameliorate these problems. As discussed below, opioids have long been used for the effective management of acute pain (e.g., acute postsurgical and postprocedural pain), but available evidence does not support the long-term use of opioids for management of chronic noncancer pain. On the other hand, evidence indicates that patients taking opioids long-term are at increased risk of OUD and opioid overdose, as well as a number of other adverse outcomes (e.g., cardiovascular events, fractures) (Baldini et al., 2012; Chou et al., 2015; Krashin et al., 2016). Nevertheless, opioids often are used in the management of chronic noncancer pain. As discussed in Chapter 1, for many years physicians prescribed opioids for chronic noncancer pain, sometimes in very high doses, because of the incorrect belief that the risk for the development of substance use disorders and addiction was low (Krashin et al., 2016). Emphasis was appropriately placed on inadequate recognition and treatment of pain. However, these concerns often were not balanced by a similar emphasis on precautions to avoid adverse effects, such as the development of addiction (Kolodny et al., 2015), and the increase in opioid prescribing that began during the 1990s was associated with a parallel increase in opioid-related substance use disorders and opioid-related deaths (Dowell et al., 2016; Kolodny et al., 2015; SAMHSA, 2015). It is estimated that opioid pain relievers (excluding nonmethadone synthetics) directly accounted for more than 17,500 deaths in 2015, up from approximately 6,160 in 1999 (NCHS, 2016). Moreover, these figures do not account for deaths from related conditions (e.g., bloodborne infections associated with OUD; see Chapters 4 and 5 for further detail). There are indications that opioid prescribing is decreasing, but as recently as 2015, tens of millions of opioids were dispensed by U.S. outpatient retail pharmacies (see Figure 1-1 in Chapter 1). The United States consumes the vast majority of opioids worldwide (Hauser et al., 2016).

    #Opioides #Utilisation_médicale #Douleurs_chroniques

  • Infectious virus in exhaled breath of symptomatic seasonal influenza cases from a college community | Proceedings of the National Academy of Sciences
    http://www.pnas.org/content/115/5/1081

    Estimation de la propagation de la grippe par aérosol dans l’air expiré :
    • il n’est pas nécessaire de tousser ou d’éternuer
    • l’émission de virus augmente avec l’indice de masse corporelle (IMC) et… la répétition de la vaccination anti grippe (pour les aérosols les plus fins et les infections des voies supérieures, à confirmer)

    Significance
    Lack of human data on influenza virus aerosol shedding fuels debate over the importance of airborne transmission. We provide overwhelming evidence that humans generate infectious aerosols and quantitative data to improve mathematical models of transmission and public health interventions. We show that sneezing is rare and not important for—and that coughing is not required for—influenza virus aerosolization. Our findings, that upper and lower airway infection are independent and that fine-particle exhaled aerosols reflect infection in the lung, opened a pathway for a deeper understanding of the human biology of influenza infection and transmission. Our observation of an association between repeated vaccination and increased viral aerosol generation demonstrated the power of our method, but needs confirmation.

    Abstract
    Little is known about the amount and infectiousness of influenza virus shed into exhaled breath. This contributes to uncertainty about the importance of airborne influenza transmission. We screened 355 symptomatic volunteers with acute respiratory illness and report 142 cases with confirmed influenza infection who provided 218 paired nasopharyngeal (NP) and 30-minute breath samples (coarse >5-µm and fine ≤5-µm fractions) on days 1–3 after symptom onset. We assessed viral RNA copy number for all samples and cultured NP swabs and fine aerosols. We recovered infectious virus from 52 (39%) of the fine aerosols and 150 (89%) of the NP swabs with valid cultures. The geometric mean RNA copy numbers were 3.8 × 104/30-minutes fine-, 1.2 × 104/30-minutes coarse-aerosol sample, and 8.2 × 108 per NP swab. Fine- and coarse-aerosol viral RNA were positively associated with body mass index and number of coughs and negatively associated with increasing days since symptom onset in adjusted models. Fine-aerosol viral RNA was also positively associated with having influenza vaccination for both the current and prior season. NP swab viral RNA was positively associated with upper respiratory symptoms and negatively associated with age but was not significantly associated with fine- or coarse-aerosol viral RNA or their predictors. Sneezing was rare, and sneezing and coughing were not necessary for infectious aerosol generation. Our observations suggest that influenza infection in the upper and lower airways are compartmentalized and independent.

    • Tiens, justement, nos amis du #Decodex sont de sortie sur le sujet…

      Les conclusions douteuses d’articles hostiles au vaccin contre la grippe
      http://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2018/02/14/les-conclusions-douteuses-d-articles-hostiles-au-vaccin-contre-la-grippe_525

      L’affirmation selon laquelle la vaccination augmenterait la « propagation de la maladie » qu’on retrouve dans certains titres n’est pas plus étayée par les faits.

      Bon, ce n’est qu’un tout petit élément du plaidoyer, mais là où ça devient cocasse, c’est quand on lit l’étude qui est (indirectement) citée pour mentionner le faible taux d’efficacité du vaccin anti grippal pour la saison2016)

      Contemporary H3N2 influenza viruses have a glycosylation site that alters binding of antibodies elicited by egg-adapted vaccine strains | Proceedings of the National Academy of Sciences
      http://www.pnas.org/content/114/47/12578

      Individuals that had been vaccinated in the previous 2 y[ears] exhibited overall lower antibody boosts (Fig. S1), after adjusting for age and prevaccination antibody titers (Table S3).

      (c’est la dernière phrase de l’article avant la Discussion)

    • Sinon, sur le fond du décodage.

      Pourquoi c’est faux

      1. Le vaccin contre la grippe offre bien une protection limitée
      M. Brownstein s’appuie sur des données compilées dans une étude publiée dans la Cochrane Library début février. Cette publication spécialisée confirme une réalité connue de longue date : le vaccin contre la grippe est loin d’offrir une protection comparable à la plupart des autres vaccins.

      Normalement, la conclusion devrait donc être : c’est plutôt vrai (et c’est bien connu, d’ailleurs…

      2. Un taux d’échec à « 99 % » fallacieux
      L’article de M. Brownstein a, en revanche, largement manipulés les chiffres de la Cochrane Library. L’étude en question aboutit, en effet, aux deux estimations suivantes :
      • En moyenne, 2,3 % des adultes en bonne santé non vaccinés seraient touchés par la grippe, contre 0,9 % des vaccinés ;
      • 21,5 % des adultes non vaccinés seraient touchés par des infections proches de la grippe, contre 18,1 % des vaccinés.

      Le chiffre de 99% est tout à fait faux, en effet. Les chiffres fournis à l’appui montre tout de même que la protection est plutôt faible.

      Le rapport des cotes (odds ratio) pour le risque d’attraper la grippe est de 2,6 entre un individu non vacciné et un individu vacciné. Ce nombre tombe à 1,2 pour les infections proches de la grippe.

      Il est également trompeur d’avoir occulté le cas des infections proches de la grippe, bien que l’écart entre les deux groupes reste également limité dans ce cas de figure.

      De fait, il est tout juste significatif. cf. le passage correspondant dans l’étude de référence

      Vaccines for preventing influenza in healthy adults. - PubMed - NCBI
      https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29388196

      MAIN RESULTS:
      […] Inactivated influenza vaccines probably reduce influenza in healthy adults from 2.3% without vaccination to 0.9% (risk ratio (RR) 0.41, 95% confidence interval (CI) 0.36 to 0.47; 71,221 participants; moderate-certainty evidence), and they probably reduce ILI from 21.5% to 18.1% (RR 0.84, 95% CI 0.75 to 0.95; 25,795 participants; moderate-certainty evidence

      (désolé, ils calculent le rapport des cotes dans le sens inverse et la (légère) différence (pour les inverses des valeurs) vient certainement des arrondis (à 1 chiffre après la virgule) des pourcentages).

      3. Les prétendus dangers du vaccin ne sont pas étayés
      […]
      L’affirmation selon laquelle la vaccination augmenterait la « propagation de la maladie » qu’on retrouve dans certains titres n’est pas plus étayée par les faits.

      cf. ci-dessus.

      4. Le vaccin reste considéré comme pertinent pour les publics ciblés
      […]
      Comme toute politique de santé publique, ce choix de recommander la vaccination contre la grippe dans certains cas fait l’objet de débats et de questionnements légitimes. Les affirmations catégoriques véhiculées par certains sites douteux n’en restent pas moins mensongères.

      Ce serait sympa (comme dirait l’autre…) si ces débâts et questionnements légitimes étaient traités autrement que par la « pédagogie » (sic) de l’extension par décret des obligations vaccinales.

    • Pour finir, le bilan de l’efficacité du vaccin pour la saison grippale 2014-15 aux États-Unis.

      Efficacité inférieure à 20% (tous âges confondus et toutes souches confondues) et inexistante pour la tranche d’âge 18-64 ans.

      2014–2015 Influenza Vaccine Effectiveness in the United States by Vaccine Type | Clinical Infectious Diseases | Oxford Academic
      https://academic.oup.com/cid/article/63/12/1564/2282808

      Background
      Circulating A/H3N2 influenza viruses drifted significantly after strain selection for the 2014–2015 vaccines. Also in 2014–2015, the Advisory Committee on Immunization Practices recommended preferential use of live attenuated influenza vaccine (LAIV) over inactivated influenza vaccine (IIV) among children aged 2–8 years.

      Methods
      Vaccine effectiveness (VE) across age groups and vaccine types was examined among outpatients with acute respiratory illness at 5 US sites using a test-negative design, that compared the odds of vaccination among reverse transcription polymerase chain reaction–confirmed influenza positives and negatives.

      Results
      Of 9311 enrollees with complete data, 7078 (76%) were influenza negative, 1840 (19.8%) were positive for influenza A (A/H3N2, n = 1817), and 395 (4.2%) were positive for influenza B (B/Yamagata, n = 340). The overall adjusted VE was 19% (95% confidence interval [CI], 10% to 27%) and was statistically significant in all age strata except those aged 18–64 years. The adjusted VE of 6% (95%CI, −5% to 17%) against A/H3N2-associated illness was not statistically significant, unlike VE for influenza B/Yamagata, which was 55% (95%CI, 43% to 65%). Among those aged 2–8 years, VE against A/H3N2 was 15% (95%CI, −16% to 38%) for IIV and −3% (CI, −50% to 29%) for LAIV; VE against B/Yamagata was 40% (95%CI, −20% to 70%) for IIV and 74% (95%CI, 25% to 91%) for LAIV.

      Conclusions
      The 2014–2015 influenza vaccines offered little protection against the predominant influenza A/H3N2 virus but were effective against influenza B. Preferential use of LAIV among young children was not supported.

      représentation graphique (en haut la souche A, en bas la souche B, la A était environ 5 fois plus fréquente que la B)

    • Pour ce dont je me souviens, et contrairement à d’autres vaccins plutôt efficaces, cette faible efficacité serait essentiellement due à un pari (industriel et sanitaire) difficile à étayer sur ce que vont donner les mutations de virus de la grippe, bien moins stables que d’autres. Une affaire de prédictibilité défaillante puisqu’on élabore les vaccins depuis des souches antérieures.

  • Le pH monte dans les rivières
    Mathieu Perreault, La Presse, Janvier 2018
    http://plus.lapresse.ca/screens/f79dd7ae-3e06-4a90-9919-0823f7276b58__7C___0.html

    Article original :

    Freshwater salinization syndrome on a continental scale.
    Kaushal SS, Likens GE, Pace ML, Utz RM, Haq S, Gorman J, Grese M.
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115:E574-E583 (2018)
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29311318

    #Rivières #Pollution #pH #acidification #salinisation #alcalinisation #océans #dérèglement_climatique #effondrement #collapsologie #catastrophe #fin_du_monde #it_has_begun #Anthropocène #capitalocène

    Ajouter à la compilation :
    https://seenthis.net/messages/499739

  • Waning plantain yields in rural Cameroon hurt college attendance
    https://news.mongabay.com/2017/12/waning-plantain-yields-in-rural-cameroon-hurt-college-attendance

    en voilà une #étude_récente intéressante

    From 1991 to 2011, as the region has grown drier and hotter, plantain yields in Cameroon have dropped by 43 percent — this despite a more than threefold increase in the area dedicated to growing the crop, researchers found. During the same period, the average duration of post-secondary school attendance decreased by six months — a decline the researchers said was “tightly linked” to the falling plantain yields.

    The lost earnings from selling fewer crops accounted for this trend, the researchers reported recently in the journal Science of the Total Environment. The scientists examined detailed records of crop production, climate patterns and social and educational demographics across Cameroon to reach this conclusion.

    ...

    Coffee, cacao and bananas are key exports. But according to the scientists, farmers in Cameroon would prefer not to grow cacao or coffee. These crops are heavily regulated by the government-run Cameroon Development Cooperation, which dictates the prices of crops sold to the U.S. and Europe.

    “They don’t even eat chocolate, so they don’t want to grow cacao,” Njabo said. “You see why [they want to grow] plantain, bush mango and safou. Farmers like to produce crops they have a say on, Njabo says, and what their families can use and consume.

    Researchers are working to identify plantain varieties that are resilient to climate change. New cultivars bred from tissue culture will create rural centers with “mother plantations” for villagers to collect offshoots to plant in their fields.

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28830045
    #climat #agriculture #agriculture_vivrière #éducation #niveau_de_vie #plantation #Cameroun

  • How much would each researcher receive if competitive government research funding were distributed equally among researchers?

    Scientists are increasingly dissatisfied with funding systems that rely on peer assessment and, accordingly, have suggested several proposals for reform. One of these proposals is to distribute available funds equally among all qualified researchers, with no interference from #peer_review. Despite its numerous benefits, such egalitarian sharing faces the objection, among others, that it would lead to an unacceptable dilution of resources. The aim of the present paper is to assess this particular objection. We estimate (for the Netherlands, the U.S. and the U.K.) how much researchers would receive were they to get an equal share of the government budgets that are currently allocated through competitive peer assessment. For the Netherlands, we furthermore estimate what researchers would receive were we to differentiate between researchers working in low-cost, intermediate-cost and high-cost disciplines. Given these estimates, we then determine what researchers could afford in terms of PhD students, Postdocs, travel and equipment. According to our results, researchers could, on average, maintain current PhD student and Postdoc employment levels, and still have at their disposal a moderate (the U.K.) to considerable (the Netherlands, U.S.) budget for travel and equipment. This suggests that the worry that egalitarian sharing leads to unacceptable dilution of resources is unjustified. Indeed, our results strongly suggest that there is room for far more egalitarian distribution of funds than happens in the highly competitive funding schemes so prevalent today.

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28886054
    #recherche #université #égalité #projets_de_recherche #économie #fonds_de_recherche
    cc @reka

  • Improbable Research #IgNobel 2017
    http://www.improbable.com/ig/winners/#ig2017

    PHYSICS PRIZE [FRANCE, SINGAPORE, USA] — Marc-Antoine Fardin, for using fluid dynamics to probe the question “Can a Cat Be Both a Solid and a Liquid?
    REFERENCE:On the Rheology of Cats,” Marc-Antoine Fardin,
    http://www.rheology.org/sor/publications/rheology_b/RB2014Jul.pdf
     
    PEACE PRIZE [SWITZERLAND, CANADA, THE NETHERLANDS, USA] — Milo Puhan, Alex Suarez, Christian Lo Cascio, Alfred Zahn, Markus Heitz, and Otto Braendli, for demonstrating that regular playing of a didgeridoo is an effective treatment for obstructive sleep apnoea and snoring.
    REFERENCE:Didgeridoo Playing as Alternative Treatment for Obstructive Sleep Apnoea Syndrome: Randomised Controlled Trial,http://www.bmj.com/content/332/7536/266
     
    ECONOMICS PRIZE [AUSTRALIA, USA] — Matthew Rockloff and Nancy Greer, for their experiments to see how contact with a live crocodile affects a person’s willingness to gamble.
    REFERENCE:Never Smile at a Crocodile: Betting on Electronic Gaming Machines is Intensified by Reptile-Induced Arousal,
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10899-009-9174-4
     
    ANATOMY PRIZE [UK] — James Heathcote, for his medical research study “Why Do Old Men Have Big Ears?
    REFERENCE: “Why Do Old Men Have Big Ears?
    http://www.bmj.com/content/311/7021/1668.short
     
    BIOLOGY PRIZE [JAPAN, BRAZIL, SWITZERLAND] — Kazunori Yoshizawa, Rodrigo Ferreira, Yoshitaka Kamimura, and Charles Lienhard, for their discovery of a female penis, and a male vagina, in a cave insect.
    REFERENCE: “Female Penis, Male Vagina and Their Correlated Evolution in a Cave Insect,
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982214003145
     
    FLUID DYNAMICS PRIZE [SOUTH KOREA, USA] — Jiwon Han, for studying the dynamics of liquid-sloshing, to learn what happens when a person walks backwards while carrying a cup of coffee. REFERENCE: “A Study on the Coffee Spilling Phenomena in the Low Impulse Regime,
    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2078152015300377
     
    NUTRITION PRIZE [BRAZIL, CANADA, SPAIN] — Fernanda Ito, Enrico Bernard, and Rodrigo Torres, for the first scientific report of human blood in the diet of the hairy-legged vampire bat
    REFERENCE: “What is for Dinner? First Report of Human Blood in the Diet of the Hairy-Legged Vampire Bat Diphylla ecaudata,
    http://www.bioone.org/doi/abs/10.3161/15081109ACC2016.18.2.017
     
    MEDICINE PRIZE [FRANCE, UK] — Jean-Pierre Royet, David Meunier, Nicolas Torquet, Anne-Marie Mouly and Tao Jiang, for using advanced brain-scanning technology to measure the extent to which some people are disgusted by cheese.
    REFERENCE: “The Neural Bases of Disgust for Cheese: An fMRI Study,
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5065955
     
    COGNITION PRIZE [ITALY, SPAIN, UK] — Matteo Martini, Ilaria Bufalari, Maria Antonietta Stazi, and Salvatore Maria Aglioti, for demonstrating that many identical twins cannot tell themselves apart visually.
    REFERENCE:Is That Me or My Twin? Lack of Self-Face Recognition Advantage in Identical Twins,
    http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0120900

    OBSTETRICS PRIZE — [SPAIN] — Marisa López-Teijón, Álex García-Faura, Alberto Prats-Galino, and Luis Pallarés Aniorte, for showing that a developing human fetus responds more strongly to music that is played electromechanically inside the mother’s vagina than to music that is played electromechanically on the mother’s belly.
    REFERENCE:Fetal Facial Expression in Response to Intravaginal Music Emission,
    http://journals.sagepub.com/doi/abs/10.1177/1742271x15609367
    REFERENCE:Fetal Acoustic Stimulation Device,” patent ES2546919B1, granted September 29, 2015 to Luis y Pallarés Aniorte and Maria Luisa López-Teijón Pérez.
    https://patents.google.com/patent/ES2546919B1/en