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  • @kassem
    Kassem @kassem CC BY-NC-SA 12/01/2021
    8
    @colporteur
    @biggrizzly
    @monolecte
    @ant1
    @olaf
    @7h36
    @fil
    @reka
    8

    La #charge_virale salivaire serait plus fiable que celle naso-pharyngée pour prédire la #sévérité de la #covid-19.

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :
    Saliva (top panels) but not NP (btm panels) viral load was elevated in hospitalized, severe and deceased patients." / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1348289323247022086

    Elle serait corrélée à une production tardive d’#anticorps.

    “Patients with high saliva viral load developed antiviral antibodies with significantly delayed kinetics than those who had low viral load.” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1348289340565176324

    https://pbs.twimg.com/media/ErYWAkIW8AEAUGD?format=jpg&name=900x900#.jpg

    Explication potentielle quant à cette différence

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : “Why is saliva viral load a better correlate of disease than NP load? We think that NP only reflects upper respiratory tract (URT) viral replication, while saliva represents both URT and lower respiratory tract. Mucociliary clearance propels virus from LRT to oral cavity.” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1348289350304477187

    https://pbs.twimg.com/media/ErYWBIuXAAEZuxC?format=jpg&name=small#.jpg

    La charge virale naso-pharyngée serait un indicateur de #contagiosité, celle salivaire de sévérité,

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :

    "URT virus is key to transmission, but LRT is key to severe #COVID19. Saliva appears to be better at capturing the critical viral source driving severe disease.
    ►https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1348289351894134785

    #PCR

    Kassem @kassem CC BY-NC-SA
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  • @kassem
    Kassem @kassem CC BY-NC-SA 4/10/2020
    1
    @02myseenthis01
    1

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :

    “Are you confused about the role of type I #interferons (IFN) in #SARS_CoV_2 infection? Here is my speculation on what makes IFN-I helpful vs. harmful in #COVID19 patients - it comes down to timing and dose. A short thread. All figures made by BioRender & @annsea_park (1/n)” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414807581487104

    https://pbs.twimg.com/media/EjMU0HEXYAEUHOZ?format=jpg&name=large#.jpg

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : “In the best case scenario, a rapid and robust induction of IFN-I should result in viral control and mild disease. This may happen in young people, or with low viral exposure settings. For a discussion we wrote, please read this. (2/n)” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414813914886145

    https://pbs.twimg.com/media/EjMU0nVX0AA_FyH?format=jpg&name=large#.jpg

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : “In older adults or after high dose viral exposure, impaired IFN response early during infection results in enhanced viral replication, and prolonged levels of IFN-I and IFN-III responses that could result in pathological consequences and severe disease. (3/n) ▻https://t.co/wRCSgRluyp” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414821330452481

    https://pbs.twimg.com/media/EjMU09YXgAQd5-V?format=jpg&name=large#.jpg

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :
    “Not all studies show this pattern. Here is a study that showed lower IFN-I levels in more severe COVID patients. It would be interesting to understand this difference. (5/n) ▻https://t.co/0pFi0VebYd” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414825348595712

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : “In the setting of host genetic mutations in viral sensors, signaling molecules, adaptors, transcription factors; or in older people with neutralizing antibodies to IFN-I, little to no IFN-I is available. Uncontrolled virus replication can lead to very severe COVID-19. (6/n)” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414830348165120

    https://pbs.twimg.com/media/EjMU1i5WoAUoHaG?format=jpg&name=medium#.jpg

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : "Papers supporting this scenario can be found here. (7/n)

    ▻https://science.sciencemag.org/content/early/2020/09/23/science.abd4585…

    ▻https://science.sciencemag.org/content/early/2020/09/29/science.abd4570…

    ►https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2768926…

    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414833414168576

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : “Finally, recombinant IFN therapy, especially given early during infection, can shut down viral replication and promote recovery. Further, prophylactic treatment with rIFN might be useful in high risk groups. (8/n)” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414838426439682

    https://pbs.twimg.com/media/EjMU2AvXkAAdkwR?format=jpg&name=large#.jpg

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : "A number of clinical trials are under way to test whether IFN therapy can help #COVID-19 patients recover quickly from infection and disease ▻https://www.clinicaltrials.gov/ct2/results?cond=COVID-19&term=interferon&cntry=&state=&city=&dist=&Sear. Thank you for reading! (End) / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1311414841144270848

    Kassem @kassem CC BY-NC-SA
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  • @kassem
    Kassem @kassem CC BY-NC-SA 4/10/2020
    1
    @02myseenthis01
    1

    Sur les différends types de #traitement par #anticorps.

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter : « Just to clear up some confusions. » / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1312565519199997953

    https://pbs.twimg.com/media/EjcrYZUWAAAmGvo?format=jpg&name=large#.jpg

    #coronavirus #covid-19

    Kassem @kassem CC BY-NC-SA
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  • @kassem
    Kassem @kassem CC BY-NC-SA 25/06/2020
    1
    @arno
    1

    Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :

    “Men are at higher risk of developing severe #COVID19 disease. We investigated whether this difference might be due to the immune response.

    Fantastic team work by taka_takehiro et al found that women develop more robust T cell response than men. (1/n)” / Twitter
    ▻https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1271071389865275392

    In COVID19 patients, men developed more proinflammatory cytokine responses, whereas women had more activated T cell response. Men’s ability to activate T cells declined with age, where women’s immune T cell response did not decline with age. (7/n)

    Kassem @kassem CC BY-NC-SA
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  • @kassem
    Kassem @kassem CC BY-NC-SA 12/02/2020
    2
    @simplicissimus
    @colporteur
    2

    #charge_virale et durée de viabilité du sars-cov2
    #Contagiosité des patients porteurs du sars-cov2

    Les super-spreaders du #coronavirus : que faut-il savoir ? - BBC News Afrique
    ▻https://www.bbc.com/afrique/monde-51452139

    https://ichef.bbci.co.uk/news/1024/branded_afrique/87E9/production/_110839743_crowd.jpg

    Qu’est-ce qu’un super-propagateur ?

    Baptisé « super-spreader » en anglais, ce terme vague, sans réelle définition scientifique, décrit une personne porteur du virus qui en contamine accidentellement plusieurs autres.

    En moyenne, chaque personne contaminée par le coronavirus le transmet à deux ou trois autres personnes.

    Mais ce n’est qu’une moyenne ; certaines personnes ne le transmettront à personne tandis que d’autres contamineront bien plus de personnes.

    Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/03/2020

      Infected people without symptoms might be driving the spread of coronavirus more than we realized - CNN
      ►https://www.cnn.com/2020/03/14/health/coronavirus-asymptomatic-spread/index.html

      https://cdn.cnn.com/cnnnext/dam/assets/200213175729-01-coronavirus-0213-super-tease.jpg

      On Tuesday, Dr. Sandra Ciesek, director of the Institute of Medical Virology in Frankfurt, Germany, tested 24 passengers who had just flown in from Israel.

      Seven of the 24 passengers tested positive for coronavirus. Four of those had no symptoms, and Ciesek was surprised to find that the viral load of the specimens from the asymptomatic patients was higher than the viral load of the specimens from the three patients who did have symptoms.

      Viral load is a measure of the concentration of the virus in someone’s respiratory secretions. A higher load means that someone is more likely to spread the infection to other people.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/03/2020

      Il est a priori contre-intuitif de retrouver une charge virale forte chez des sujets asymptomatiques (donc a priori avec une forte immunité) (?)

      Une compilation sur ce sujet :
      ►https://seenthis.net/messages/842370

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @arno
      ARNO* @arno ART LIBRE 15/03/2020

      En français, c’est très classiquement ce qu’on appelle un porteur sain.

      ARNO* @arno ART LIBRE
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/03/2020

      Ce n’est pas du tout le sujet. La question que je soulève est qu’il est a priori contre-intuitif qu’un porteur sain soit porteur d’une charge virale bien plus forte que la moyenne.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @arno
      ARNO* @arno ART LIBRE 15/03/2020

      OK, merci. J’en étais plus resté à la lecture des articles qu’à ton commentaire, et les articles (notamment celui de CNN) développement assez longuement le principe de porteur qui n’a pas de symptômes mais transmet le virus (ce qui, pour le coup, ne me semblait pas du tout inhabituel).

      ARNO* @arno ART LIBRE
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/03/2020

      Ceci dit les cas asymptomatiques peuvent être non pas des porteurs sains mais en période d’incubation (pré-symptomatiques).

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/03/2020

      Coronavirus : au moins une contamination sur deux due à une personne sans symptômes
      ►https://www.allodocteurs.fr/maladies/maladies-infectieuses-et-tropicales/coronavirus/coronavirus-au-moins-une-contamination-sur-deux-due-a-une-personne-sans

      https://www.allodocteurs.fr/media/20200313-coronavirus-covid19.jpg

      Or, pour combattre l’épidémie, une partie des mesures consiste à rechercher les cas et à identifier leurs contacts malades. « Cela signifie que l’efficacité [de ces mesures] dans la prévention des infections Covid-19 sera considérablement plus faible que l’efficacité de la prévention du SRAS ou des infections MERS (deux virus de la même famille que le Covid-19, ndlr), où la transmission pré-symptomatique ne jouait pas un rôle important » notent les chercheurs dans leur étude.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/03/2020

      Ici un patient qui a contaminé deux personnes pendant sa phase pré-symptomatique (non testé à ce moment là), et qui avait un PCR fortement positif alors qu’il n’avait plus de symptômes. Les auteurs posent la question de savoir s’il s’agit de virus encore viables. Dans le cas contraire on pourrait théoriquement avoir un PCR (éventuellement fortement) positif sans être contagieux.

      Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany | NEJM
      ▻https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2001468

      https://www.nejm.org/na101/home/literatum/publisher/mms/journals/content/nejm/2020/nejm_2020.382.issue-10/nejmc2001468/20200228/images/img_medium/nejmc2001468_f1.jpeg

      ... the detection of 2019-nCoV and a high sputum viral load in a convalescent patient (Patient 1) arouse concern about prolonged shedding of 2019-nCoV after recovery. Yet, the viability of 2019-nCoV detected on qRT-PCR in this patient remains to be proved by means of viral culture.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 25/03/2020

      Dr Siouxsie Wiles sur Twitter : “For everyone hearing that the coronavirus “survives” for 17 days. This is not what the CDC reported. They detected its genetic material after 17 days. They didn’t test whether the virus was viable. For context, you can destroy a virus in an autoclave & still detect it this way.”
      ▻https://seenthis.net/messages/834126

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 28/03/2020

      Understanding COVID-19 : what does viral RNA load really mean ? - The Lancet Infectious Diseases
      ►https://seenthis.net/messages/835591

      https://seenthis.net/local/cache-vignettes/L181xH96/fx1jpg-8986e8986-f42a6.jpg

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 1/04/2020

      Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019 | Nature
      ▻https://seenthis.net/messages/837496

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 17/04/2020

      Does high viral load increase ability to pass the virus to others?
      ►https://theconversation.com/what-we-do-and-do-not-know-about-covid-19s-infectious-dose-and-vira

      In general, the more virus you have in your airways, the more you will release when you exhale or cough, although there is a lot of person-to-person variation. Multiple studies have reported that patients have the highest viral load of the coronavirus at the time they are diagnosed.

      This means that patients transmit COVID-19 more effectively at the beginning of their illness, or even before they know they are sick. This is bad news. It means people who look and feel healthy can transmit the virus to others.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 5/05/2020

      Contact Tracing Assessment of COVID-19 Transmission Dynamics in Taiwan and Risk at Different…
      ►https://seenthis.net/messages/850588

      Dans cette étude les sujets symptomatiques ne sont contagieux que quelques jours avant et jusqu’à 5 jours après le début de leurs symptômes, alors même que le PCR reste positif au-delà du cinquième jour. Un sujet asymptomatique (9 cas) n’a jamais été contagieux.

      Illustré par Siouxsie Wiles & Toby Morris
      ▻https://seenthis.net/messages/850588#message850835

      https://thespinoff.co.nz/wp-content/uploads/2020/05/Covid-19-Time-Course-05.gif

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 10/05/2020

      Revue succincte de la littérature sur les modes de transmission du sars-cov2 Thread by mugecevik : A…
      ▻https://seenthis.net/messages/851985

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 10/05/2020

      Les écoles vont rouvrir, mais les scientifiques essaient toujours de comprendre comment les enfants…
      ►https://seenthis.net/messages/851543

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 16/05/2020

      Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2 | Infectious Diseases | JAMA | JAMA Network

      ▻https://seenthis.net/messages/852413#message852496

      https://seenthis.net/local/cache-vignettes/L600xH382/EXW05l4UcAEi580e-75e58.jpg

      Cite une étude de 9 cas où aucune culture n’est revenue positive 8 jours après le début des symptômes.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 20/05/2020

      Why do some COVID-19 patients infect many others, whereas most don’t spread the virus at all ? |…
      ►https://seenthis.net/messages/854393

      10% des contaminés seraient responsables de 80% des transmissions.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 25/05/2020

      Position Statement from the National Centre for Infectious Diseases and the Chapter of Infectious…
      ►https://seenthis.net/messages/855917

      Compte-rendu de l’expérience singapourienne sur la période de #contagiosité du #sars_cov2

      – Les cultures de sars_cov2 n’ont jamais été positives après le 11ieme jour ou lorsque le cycle de seuil (Ct ; d’autant plus élevé que la charge virale au #PCR est faible) est supérieur ou égal à 30 : les patients pourraient donc être autorisés à sortir de l’hôpital avant la négativité du PCR qui peut prendre plus d’un mois,
      – il n’a pas été retrouvé de transmission par des sujets asymptomatiques (à la différence des pré-symptomatiques).

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 31/05/2020

      It’s Not Whether You Were Exposed to the Coronavirus. It’s How Much. - The New York Times
      ▻https://seenthis.net/messages/857394

      Generally, people who harbor high levels of pathogens — whether from influenza, H.I.V. or SARS — tend to have more severe symptoms and are more likely to pass on the pathogens to others.

      But in the case of the new coronavirus, people who have no symptoms seem to have viral loads — that is, the amount of virus in their bodies — just as high as those who are seriously ill, according to some studies.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 1/06/2020

      Contagiosité improbable après 7 jours de maladie et/ou Ct supérieur ou égal à 24.
      ▻https://seenthis.net/messages/857780

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 9/06/2020

      Natural history and transmission potential of asymptomatic SARS-CoV-2 infection | Clinical…
      ▻►https://seenthis.net/messages/859749

      Nasal swabbing showed that the infected but asymptomatic study participants had lower levels of viral RNA than infected people who felt ill at some point.

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 24/06/2020

      How ’Superspreading’ Events Drive Most COVID-19 Spread - Scientific American
      ►https://seenthis.net/messages/862821

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 17/07/2020

      Early Release - Contact Tracing during Coronavirus Disease Outbreak, South Korea, 2020 - Volume 26,…
      ►https://seenthis.net/messages/867771

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 18/07/2020

      Duration of Isolation and Precautions for Adults with COVID-19 | CDC
      ▻https://seenthis.net/messages/867867

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 30/07/2020

      VIDAL - COVID-19 : les mesures_barrières préviennent-elles l’apparition de symptômes en cas d’infection ?
      ▻https://seenthis.net/messages/869831

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 25/08/2020

      Etats-Unis : un seul événement à l’origine de l’épidémie de Covid-19 à travers le pays ? - L’Express
      ▻https://seenthis.net/messages/873197

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 15/12/2020

      Covid-19 : la chasse aux super-propagateurs pour réussir le déconfinement - Science & Vie
      ▻https://seenthis.net/messages/891150

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 12/01/2021

      La charge virale naso-pharyngée serait un indicateur de #contagiosité, celle salivaire de sévérité,

      Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :

      "URT virus is key to transmission, but LRT is key to severe #COVID19. Saliva appears to be better at capturing the critical viral source driving severe disease.
      ►https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1348289351894134785

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
    • @kassem
      Kassem @kassem CC BY-NC-SA 13/01/2021

      Viral kinetics of SARS-CoV-2 over the preclinical, clinical, and postclinical period - PubMed
      ▻https://seenthis.net/messages/895959

      https://seenthis.net/local/cache-vignettes/L600xH311/gr2_lrgjpg-ee606-1f273.jpg

      Kassem @kassem CC BY-NC-SA
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