Santé Publique France, 1/12/2020 :
• décès covid à l’hôpital : 363 (extrapolé, 318)
• hospitalisations covid : 27 611 (-618)
• décès covid en EHPAD : 412 (extrapolé, 407)
https://dl.dropbox.com/s/qebqlb7izna593g/20201201_SPF_covid.png 
https://dl.dropbox.com/s/eq8fmlk3mku87l0/20201201_SPF_EHPAD.png pas vraiment d’écarts par rapport aux tendances extrapolées
(décroissance peut-être un petit peu moins rapide pour les décès à l’hôpital)
1er décembre : les décès, j’ai bien une tendance à la baisse, mais c’est ultra-mou. Par rapport aux déclarations de Castex qui explique qu’il a une chute de R_effectif beaucoup plus importante que pour la première vague, ça ne se voit pas dans le ralentissement des décès.
Sur 21 jours, la pente n’est pas du tout spectaculaire :
Et par rapport à la baisse de la première vague, ça donne l’impression de baisser deux fois moins vite (au pifomètre) :
en no-log, pour la métropole et les réa, moyennes 7 j, ça donne ça :
j’ai l’impression qu’il n’y a plus que 3 départements à la traine question dc : 38, 74 et 73 ; ces 3 là sont encore à un niveau de dc coviiid > 50% de leur mortalité habituelle.
le 38 stagne depuis en gros un mois à ce niveau et les réas décroissent à seulement /2 tous les 30 jours
le 73 et le 74 ont des réa /2 en 13 jours et des dc en baisse, surtout le 74
version log-scale, avec regression sur dc : ça descend à /2 en 41 jours
j’ai aligné le tronçon de régression réa aussi au 18 nov.
pour l’épisode 1 ça descendait à /2 en 12 jours, au début :
Les hospi des 10-19 ans continuent à augmenter, sans aucune corrélation avec le reste. Ce qui pose des questions sur la fiabilité des données depuis 15 jours - 3 semaines.
Je ne vois pas trop le poids des 10-19 ans sur l’ensemble des hospitalisations (la courbe en rouge)
(données au 1/12/2020)
en échelle arithmétique (no log)
en échelle logarithmique
Santé Publique France, 16/11/2020
(le bazar dans le csv, ça continue, cf. ▻https://seenthis.net/messages/886863 )
• décès covid à l’hôpital : 506
• hospitalisations covid : 33 497 (+416)
pile sur mon extrapolation (à l’épaisseur du trait près, j’avais 526…)
pour l’instant, plafonnement
plafonnement pour les morts, mais baisse (du flux) sur les réa : pour la métropole, c’est /2 en 35 jours sur les admissions réa depuis une semaine, et /2 en 19 j pour IDF, sur les moyennes mobiles 7 j
Du coup, je regarde les 4 séries du fichier csv.
(ce que je n’ai pas fait jusqu’ici)
• les entrées en réa ont commencé à plafonner le 26/10, sont restées stables un peu plus d’une semaine avant de commencer une forte décrue
• à l’œil, on peut considérer que les décès sont décalés de 15 jours
• on aurait donc une semaine à peu près stable pour les décès et une décroissance à partir du milieu de la semaine prochaine (24/11 ?)
• toujours à la louche, les radiations tournent autour de 5% du stock d’hospitalisations (un peu plus de 2 bandes de graduation d’écart avec un facteur 100 entre les 2 systèmes de graduation) soit environ un temps de séjour moyen de l’ordre de 20 jours (je sais, on n’est pas en régime stationnaire, mais on va faire comme si…)
pour l’extrapolation, c’est très empirique
et j’ai affiné au fur et à mesure du temps
• j’ai d’abord commencé par estimer une simple tendance exponentielle
• devant la régularité d’horloge de la courbe en octobre (contrairement à ce que déclarent certains…), j’ai estimé le poids des jours de semaine (rapports à la tendance, moyennés, même pas centrés - leur moyenne fait presque 1,05)
• que j’applique en extrapolation sur ma tendance
ça c’était quand ça montait
à partir du moment où ça ne monte plus, pas d’estimation de (la nouvelle) tendance possible, donc là, faut choisir, en gros entre stagnation ou retournement. De façon heuristique (doigt mouillé…), j’ai choisi la première, en appliquant les coefficients des jours de semaine calculés précédemment.
le décalage temporel entre les courbes réa et dc, je l’ai suivi depuis avril : c’est les +<nb> j sur mon graphique métropole, les tronçons rouge sont des bouts de la courbe réa, décalés, et un peu écrasés cf ▻https://github.com/ofa-/predictor/blob/master/predictor.py#L134-L137
ça marchait assez bien pour l’épisode 1, montée, descente, et environ pour les vacances d’été ; et ça marchait aussi pas mal sur une bonne partie de la montée de l’épisode 2 ;
mais là ça colle plus depuis 1-2 semaines :-( ; ptet un pb avec mon scaling - il aligne les courbes en hauteur sur le pic de l’épisode 1.
question interprétation, je voulais vérifier si on pouvait y voir un vague prédicteur de dc : en utilisant réa scaled+shifted, ça paraît vaguement intuitif, si on dit que réa = antichambre de la morgue ; du coup, on a +nb jours de prédiction de dc à peu de frais en translatant réa ; bon aussi, les deux phénomènes sont globalement de belles exponentielles, alors ça peut coller :-) mais la synchro est troublante, surtout sur une si longue période.
aussi, j’ai l’impression que la « compression » (diminution de l’écart temporel entre les deux courbes) indique une phase de crise.
un avis ?
Santé Publique France, 13/11/20 :
• décès covid à l’hôpital : 456
• hospitalisations : 32 707 (+24)
• décès en EHPAD : 476 (en 3 jours)
pour ces trois chiffres, on continue à plafonner
https://dl.dropbox.com/s/bg2300lokgc0qxv/20201113_spf_covid.png 
https://dl.dropbox.com/s/w9bgzm1s314o2v2/20201113_SPF_EHPAD.png côté Insee, décès quotidiens au 02/11/20
depuis le 01/03/20 (pour la référence à la première vague)
en restreignant depuis le 30/08/20
sur les deux semaines depuis environ le 20 octobre (jusqu’au 2 novembre, 11 jours de décalage pour cette statistique), la surmortalité reste stable autour de +400 / +500 décès supplémentaires par jour
L’analyse par département des chiffres de l’Insee montre bien que les départements touchés par la seconde vague ne sont pas ceux de la première. Quelques exemples :
(note : les échelles verticales sont différentes)
Paris
Seine-Saint-Denis
a contrario
Bouches-du-Rhône
ou la Savoie qui défraie les médias
enfin, le Rhône qui est impacté par les deux vagues
Le commentaire du Monde sur les données de l’Insee
Coronavirus : un excès de mortalité de 10 % observé par rapport à l’automne 2019
▻https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/11/13/coronavirus-un-exces-de-mortalite-de-10-observe-par-rapport-a-l-automne-2019
Le décompte des décès publié par l’Insee montre une nette hausse depuis ces quatre dernières semaines.
[…]
20 % d’excès de mortalité en Auvergne-Rhône-Alpes
2018 et 2019 sont réputées être des années à faible mortalité (de mémoire, je sais plus ou j’ai lu ça) ; faut prendre ça en compte dans le comparaisons avec 2020.
et l’été 2020 a aussi battu des records question canicule ; on voit bien le pic de mortalité au mois d’août :-) - j’ai pourtant pas souvenir d’avoir entendu parler de mortalité caniculaire à l’époque :-p
Santé Publique France, 8 novembre : 270 décès dûs au covid à l’hôpital, +6,2% / jour, en légère baisse. Peut-être un début d’inflexion ?
30217 hospitalisations, petite reprise ?…
On semble légèrement dévier de la croissance exponentielle, par exemple pour les hospitalisations. Le pic serait en vue ?
GRZ @GuillaumeRozier sur twitaire
Si c’est l’effet des vacances, on va vite être fixés…
hum... 10-15 jours de hausse avant le pic, puis un plateau (pourvu que ce soit pas un faux-plat)
Coronavirus : Olivier Véran estime qu’il y a « une forme de ralentissement » dans la progression de l’épidémie
▻https://www.20minutes.fr/societe/2904011-20201108-coronavirus-olivier-veran-estime-forme-ralentissement-pro
Les mesures prises « ont permis d’avoir une forme de ralentissement de la progression de l’épidémie mais il est trop tôt pour juger de l’effet du reconfinement », a-t-il déclaré dimanche dans l’émission Questions Politiques (France Inter/franceinfo/Le Monde).
Ah, le fameux ralentissement de l’augmentation, si cher à la communication politique moderne. En français : « ça continue d’augmenter, mais moins que si ça avait été pire ».
Ce qui permet à Sputnik (et je suppose que ce ne sont pas les seuls) de démontrer qu’ils n’ont pas compris :
C’est intéressant comme expérience en grandeur réelle. Juste ennuyeux que l’on soit les cobayes de l’expérience.
dans le 34 c’est même carrément une descente (de la croissance) depuis une semaine ; dans le 69 c’est un bon plat depuis 6 jours, dans le 38 depuis 5 jours ; en IDF c’est plateau des réa depuis 7 jours et des dc depuis 3 jours
▻http://coviiid.free.fr/snap/2020-11-08
–—
Une petite extrapolation (tendance estimée depuis le 30/09, profil hebdomadaire moyen des semaines 41 à 45) des décès.
Attention, je ne dis pas prévision, l’objectif est de détecter l’inflexion (là où la pente commence à décroître et donc la croissance ralentit)
|----------|------------|-----|
| lundi | 09/11/2020 | 565 |
| mardi | 10/11/2020 | 570 |
| mercredi | 11/11/2020 | 589 |
| jeudi | 12/11/2020 | 554 |
| vendredi | 13/11/2020 | 603 |
| samedi | 14/11/2020 | 478 |
| dimanche | 15/11/2020 | 439 |
|----------|------------|-----|
l’inflexion a lieu en gros entre le 30 oct et le 2 nov, c’est ça ?
trop fort cette confinure, elle a des effets immédiats, voire même rétroactifs :-p
Oui, l’inflexion pour les hospitalisations, ce serait même autour du 27-28 octobre. Mais comme discuté précédemment, l’interprétation n’est pas évidente et ça pourrait aussi résulter de l’approche de la saturation des hôpitaux… d’où… la reconfiture :-P
Ceci dit, le point d’hier repart dans l’autre sens…
Pour les décès, le chiffre d’hier pourrait être une première indication de l’inflexion. À confirmer,… d’où la mise en place de l’extrapolation.
La conjoncture, c’est, non pas prévoir, mais interpréter la valeur du jour, en anglais, on dit maintenant #nowcasting
en décalant de 2 jours mon tronçon de régression sur les réa, je trouve même un « presque plat » pour métropole, depuis 5 jours [temps x2 = 56 jours contre 32 j ci-dessus] ; j’aurai dû mieux régler hier :-)
le « décrochage » des courbes dc et réa était quasi synchrone vers le 12 octobre ; pour dc, belle droite depuis, jusqu’au 6 novembre.
(courbes = moyenne glissantes 7 jours précédents)
▻https://slack-files.com/TSJDKS71D-F01E49H2B9C-85257e1f31/coviiid-2020-11-09.png
9 novembre : 544 décès, un poil moins qu’extrapolé, mais on est dans l’épaisseur du trait…
pour les hospitalisations, l’accroissement est (légèrement) supérieur à celui d’hier (idem, dans l’épaisseur du trait) mais ça confirme le constat de la veille
(à suivre)
10 novembre : 466 décès, très nettement inférieur à l’extrapolation (570)
idem, net ralentissement du stock d’hospitalisations : 31477, soit un accroissement de 379 seulement
Problèmes de remontée des chiffres ? à cette heure, presque 21h, on ne dispose pas encore des chiffres des EHPAD.
Demain, jour férié, on peut s’attendre à des difficultés de remontée également…
EDIT : 754 décès en EHPAD (sur 4 jours), là on est (un peu) au dessus de la tendance (706 extrapolés)
