Covid-19 : la chasse aux super-propagateurs pour réussir le déconfinement

Infected people without symptoms might be driving the spread of coronavirus more than we realized - CNN
►https://www.cnn.com/2020/03/14/health/coronavirus-asymptomatic-spread/index.html

https://cdn.cnn.com/cnnnext/dam/assets/200213175729-01-coronavirus-0213-super-tease.jpg

On Tuesday, Dr. Sandra Ciesek, director of the Institute of Medical Virology in Frankfurt, Germany, tested 24 passengers who had just flown in from Israel.

Seven of the 24 passengers tested positive for coronavirus. Four of those had no symptoms, and Ciesek was surprised to find that the viral load of the specimens from the asymptomatic patients was higher than the viral load of the specimens from the three patients who did have symptoms.

Viral load is a measure of the concentration of the virus in someone’s respiratory secretions. A higher load means that someone is more likely to spread the infection to other people.

Il est a priori contre-intuitif de retrouver une charge virale forte chez des sujets asymptomatiques (donc a priori avec une forte immunité) (?)

Une compilation sur ce sujet :
►https://seenthis.net/messages/842370

En français, c’est très classiquement ce qu’on appelle un porteur sain.

Ce n’est pas du tout le sujet. La question que je soulève est qu’il est a priori contre-intuitif qu’un porteur sain soit porteur d’une charge virale bien plus forte que la moyenne.

OK, merci. J’en étais plus resté à la lecture des articles qu’à ton commentaire, et les articles (notamment celui de CNN) développement assez longuement le principe de porteur qui n’a pas de symptômes mais transmet le virus (ce qui, pour le coup, ne me semblait pas du tout inhabituel).

Ceci dit les cas asymptomatiques peuvent être non pas des porteurs sains mais en période d’incubation (pré-symptomatiques).

Coronavirus : au moins une contamination sur deux due à une personne sans symptômes
►https://www.allodocteurs.fr/maladies/maladies-infectieuses-et-tropicales/coronavirus/coronavirus-au-moins-une-contamination-sur-deux-due-a-une-personne-sans

https://www.allodocteurs.fr/media/20200313-coronavirus-covid19.jpg

Or, pour combattre l’épidémie, une partie des mesures consiste à rechercher les cas et à identifier leurs contacts malades. « Cela signifie que l’efficacité [de ces mesures] dans la prévention des infections Covid-19 sera considérablement plus faible que l’efficacité de la prévention du SRAS ou des infections MERS (deux virus de la même famille que le Covid-19, ndlr), où la transmission pré-symptomatique ne jouait pas un rôle important » notent les chercheurs dans leur étude.

Ici un patient qui a contaminé deux personnes pendant sa phase pré-symptomatique (non testé à ce moment là), et qui avait un PCR fortement positif alors qu’il n’avait plus de symptômes. Les auteurs posent la question de savoir s’il s’agit de virus encore viables. Dans le cas contraire on pourrait théoriquement avoir un PCR (éventuellement fortement) positif sans être contagieux.

Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany | NEJM
▻https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2001468

https://www.nejm.org/na101/home/literatum/publisher/mms/journals/content/nejm/2020/nejm_2020.382.issue-10/nejmc2001468/20200228/images/img_medium/nejmc2001468_f1.jpeg

... the detection of 2019-nCoV and a high sputum viral load in a convalescent patient (Patient 1) arouse concern about prolonged shedding of 2019-nCoV after recovery. Yet, the viability of 2019-nCoV detected on qRT-PCR in this patient remains to be proved by means of viral culture.

Dr Siouxsie Wiles sur Twitter : “For everyone hearing that the coronavirus “survives” for 17 days. This is not what the CDC reported. They detected its genetic material after 17 days. They didn’t test whether the virus was viable. For context, you can destroy a virus in an autoclave & still detect it this way.”
▻https://seenthis.net/messages/834126

Understanding COVID-19 : what does viral RNA load really mean ? - The Lancet Infectious Diseases
►https://seenthis.net/messages/835591

https://seenthis.net/local/cache-vignettes/L181xH96/fx1jpg-8986e8986-f42a6.jpg

Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019 | Nature
▻https://seenthis.net/messages/837496

Does high viral load increase ability to pass the virus to others?
►https://theconversation.com/what-we-do-and-do-not-know-about-covid-19s-infectious-dose-and-vira

In general, the more virus you have in your airways, the more you will release when you exhale or cough, although there is a lot of person-to-person variation. Multiple studies have reported that patients have the highest viral load of the coronavirus at the time they are diagnosed.

This means that patients transmit COVID-19 more effectively at the beginning of their illness, or even before they know they are sick. This is bad news. It means people who look and feel healthy can transmit the virus to others.

Contact Tracing Assessment of COVID-19 Transmission Dynamics in Taiwan and Risk at Different…
►https://seenthis.net/messages/850588

Dans cette étude les sujets symptomatiques ne sont contagieux que quelques jours avant et jusqu’à 5 jours après le début de leurs symptômes, alors même que le PCR reste positif au-delà du cinquième jour. Un sujet asymptomatique (9 cas) n’a jamais été contagieux.

Illustré par Siouxsie Wiles & Toby Morris
▻https://seenthis.net/messages/850588#message850835

https://thespinoff.co.nz/wp-content/uploads/2020/05/Covid-19-Time-Course-05.gif

Revue succincte de la littérature sur les modes de transmission du sars-cov2 Thread by mugecevik : A…
▻https://seenthis.net/messages/851985

Les écoles vont rouvrir, mais les scientifiques essaient toujours de comprendre comment les enfants…
►https://seenthis.net/messages/851543

Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2 | Infectious Diseases | JAMA | JAMA Network

▻https://seenthis.net/messages/852413#message852496

https://seenthis.net/local/cache-vignettes/L600xH382/EXW05l4UcAEi580e-75e58.jpg

Cite une étude de 9 cas où aucune culture n’est revenue positive 8 jours après le début des symptômes.

Why do some COVID-19 patients infect many others, whereas most don’t spread the virus at all ? |…
►https://seenthis.net/messages/854393

10% des contaminés seraient responsables de 80% des transmissions.

Position Statement from the National Centre for Infectious Diseases and the Chapter of Infectious…
►https://seenthis.net/messages/855917

Compte-rendu de l’expérience singapourienne sur la période de #contagiosité du #sars_cov2

– Les cultures de sars_cov2 n’ont jamais été positives après le 11ieme jour ou lorsque le cycle de seuil (Ct ; d’autant plus élevé que la charge virale au #PCR est faible) est supérieur ou égal à 30 : les patients pourraient donc être autorisés à sortir de l’hôpital avant la négativité du PCR qui peut prendre plus d’un mois,
– il n’a pas été retrouvé de transmission par des sujets asymptomatiques (à la différence des pré-symptomatiques).

It’s Not Whether You Were Exposed to the Coronavirus. It’s How Much. - The New York Times
▻https://seenthis.net/messages/857394

Generally, people who harbor high levels of pathogens — whether from influenza, H.I.V. or SARS — tend to have more severe symptoms and are more likely to pass on the pathogens to others.

But in the case of the new coronavirus, people who have no symptoms seem to have viral loads — that is, the amount of virus in their bodies — just as high as those who are seriously ill, according to some studies.

Contagiosité improbable après 7 jours de maladie et/ou Ct supérieur ou égal à 24.
▻https://seenthis.net/messages/857780

Natural history and transmission potential of asymptomatic SARS-CoV-2 infection | Clinical…
▻►https://seenthis.net/messages/859749

Nasal swabbing showed that the infected but asymptomatic study participants had lower levels of viral RNA than infected people who felt ill at some point.

How ’Superspreading’ Events Drive Most COVID-19 Spread - Scientific American
►https://seenthis.net/messages/862821

Early Release - Contact Tracing during Coronavirus Disease Outbreak, South Korea, 2020 - Volume 26,…
►https://seenthis.net/messages/867771

Duration of Isolation and Precautions for Adults with COVID-19 | CDC
▻https://seenthis.net/messages/867867

VIDAL - COVID-19 : les mesures_barrières préviennent-elles l’apparition de symptômes en cas d’infection ?
▻https://seenthis.net/messages/869831

Etats-Unis : un seul événement à l’origine de l’épidémie de Covid-19 à travers le pays ? - L’Express
►https://seenthis.net/messages/873197

Covid-19 : la chasse aux super-propagateurs pour réussir le déconfinement - Science & Vie
▻https://seenthis.net/messages/891150

La charge virale naso-pharyngée serait un indicateur de #contagiosité, celle salivaire de sévérité,

Prof. Akiko Iwasaki sur Twitter :

"URT virus is key to transmission, but LRT is key to severe #COVID19. Saliva appears to be better at capturing the critical viral source driving severe disease.
►https://twitter.com/VirusesImmunity/status/1348289351894134785

Viral kinetics of SARS-CoV-2 over the preclinical, clinical, and postclinical period - PubMed
▻https://seenthis.net/messages/895959

https://seenthis.net/local/cache-vignettes/L600xH311/gr2_lrgjpg-ee606-1f273.jpg

Catch me if you can : Superspreading of SARS-CoV-2 : Trends in Microbiology
▻https://seenthis.net/messages/915324